Les bureaux de vote sont ouverts dans l'Yonne depuis 8 heures jusqu'à 19 heures pour le deuxième tour de l'élection présidentielle. Le taux de participation à 17 heures dans l'Yonne s'élève à 67,35%. Les électeurs se sont bien moins mobilisés qu'au second tour en 2012, où le taux de participation s'établissait à 72,75% à 17 heures.